卷首为十二经脉和脏腑图，次分十二经脉逐条阐述。每经首列《灵枢·经脉》中有关条文，后对经脉解、诸穴歌、病证解、本草脏腑虚实标本用药式等详加论述，末附《奇经八脉歌》，示明其大致循行路线；《穴同名异类》，指明一穴二名，乃至一穴六名之处；《名同穴异类》，指出二人一名之现象。本书以引经、绘图、论述相结合，并将理法方药一以贯之。对脏腑辨证、十二经脉辨证及其治疗（用药、针灸等）阐发最详，意在“指归”。