卷1～2为伤寒；卷3～6为天行、温病、疟疾、霍乱等；卷7～20为心痛、痰饮、咳嗽等内科杂病；卷21～22为五官科疾病；卷23～24为瘿瘤、痈疽等；卷25～27为痢、痔诸病；卷28～30为中恶、金疮、恶疾等；卷31～32为采药、丸散、面部诸疾；卷33～36为妇儿疾病；卷37～38为乳石；卷39～40为明堂灸法。全书共1104门,均先论后方,载方6000余首。凡书中引用书籍都详细注明出处,保存大量唐以前医学文献,为研究中国医疗技术史及发掘中医宝库提供了极为宝贵的资料和考察依据。公元1069年,本书曾经北宋校正医书局校刻。1640年又经程衍道校勘,1949年后有影印本。